Webinar - come usare FoodMicrobionet per estrarre e processare dati sulla composizione delle comunità microbiche degli alimenti - Prof Eugenio Parente

In questo webinar (18/6/2024 dalle 10 alle 12), destinato a dottorandi e giovani ricercatori che si occupano della struttura delle comunità microbiche degli alimenti, presenterò la nuova versione di FoodMicrobionet che finalmente include dati anche sulle comunità microbiche fungine. Dimostrerò praticamente come, utilizzando le risorse presenti in GitHub (https://github.com/ep142/FoodMicrobionet), Mendeley data (https://data.mendeley.com/datasets/8fwwjpm79y/9) e Zenodo (https://zenodo.org/records/10993241) è possibile realizzare attività di estrazione ed elaborazione statistica e grafica dei dati di diverso tipo. come eseguire semplici ricerche ed elaborazioni con l'app interattiva ShinyFMBN come estrarre oggetti di classe phyloseq con criteri di ricerca più raffinati quali script usare per: realizzare analisi statistiche e grafiche sulla distribuzione di un determinato gruppo microbico in una o più classi di alimenti combinare i propri risultati con quelli di FoodMicrobionet realizzare metastudi sulla composizione microbica di diverse classi di alimenti fare inferenza di reti di associazioni microbiche.

La nuova versione è descritta in un lavoro pubblicato su Foods: https://doi.org/10.3390/foods13111689 ed è stata finanziata a valere sul PRIN 2022 PNRR Progetto NYC diversity P20229JMMH finanziato da European Union Next-GenerationEU, CUP C53D23007560001 (PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR)—MISSIONE 4 COMPONENTE 2, INVESTIMENTO 1.4—D.D. 1364/2023). Il webinar fa parte dell'attività di divulgazione del progetto.

Per partecipare al seminario è sufficiente usare il link Presentazione FMBN 5.0 https://meet.google.com/oor-zzig-exy

PER MIGLIORARE LA VOSTRA ESPERIENZA E' NECESSARIO, COME MINIMO, SCARICARE E ISTALLARE R E RSTUDIO E SCARICARE LA SHINY APP DA MENDELEY DATA (VEDI SOPRA).

Cordiali saluti